Men theo các bậc thang bên hông chùa Bà Đen, du khách đi theo bảng chỉ dẫn sẽ lên tới Chùa Linh Sơn Hoà Đồng (Chùa Hoà Đồng), ngôi chùa được xây dựng theo kiến trúc quen thuộc của chùa miếu Nam Bộ.
Chùa Linh Sơn Hòa Đồng được khôi phục lại từ một ngôi chùa cũ nơi Hòa Thượng Thích Giác Điền từng tu tập trong những năm giữa thế kỷ 20. Chùa cũ cũng đã chịu chung số phận với với các ngôi chùa khác trong quần thể chùa am trên núi vào những năm chiến tranh ác liệt, sau đó được Ni trưởng Viện chủ chùa núi Bà Thích Nữ Diệu Nghĩa cho khôi phục lại. Chùa Hòa Đồng được bố trí mặt bằng theo lối quen thuộc của chùa miếu Nam Bộ. Nghĩa là có hai lớp nhà liên tục song song nhau, lớp sau lớp trước. Lớp chính điện phía trước cấu trúc kiểu tứ tụ (bộ khung bốn cột ở giữa) với 3 gian, 3 nhịp. Chung quanh 3 mặt trước và bên còn thêm một hành lang rộng 1.50m. Phần mặt bằng chính điện có kích thước ngang 10,8m sâu vào 9,9m. Vậy là, chùa Hòa Đồng có diện tích chỉ độ gần 200m2, nhưng với cấu trúc hợp lý đã làm tăng thêm nét cổ kính của ngôi chùa.
Nằm biệt lập ở một góc núi Bà Đen và có diện tích chỉ khoảng 200m2 nên không gian Chùa Hoà Đồng rất tĩnh mịch, bình yên. Đặc biệt, lối dẫn vào chùa được xây dựng thiết kế như cây cầu gỗ và mái che được lợp bởi những tán cây rừng nên không gian rất xanh mát, đồng thời có thể thoả thích ngắm cảnh núi non và đồng bằng từ độ cao 350m.
